<div dir="ltr">Benji, <div><br></div><div>It seems that <font face="Calibri, sans-serif"><span style="font-size:14.545454025268555px">drmaa support is broken in torque 4.x. It will most likely require a patch because the drmaa code is still referring to the old pbs_submit() function instead of the newer pbs_submit_hash()</span></font></div>

<div><font face="Calibri, sans-serif"><span style="font-size:14.545454025268555px"><br></span></font></div><div><font face="Calibri, sans-serif"><span style="font-size:14.545454025268555px"><br></span></font></div></div>
<div class="gmail_extra">
<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Oct 15, 2013 at 5:08 PM, Benji Wakely <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:B.Wakely@latrobe.edu.au" target="_blank">B.Wakely@latrobe.edu.au</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">







<div lang="EN-AU" link="blue" vlink="purple">
<div>
<p class="MsoNormal">Greetings,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Short version:<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Anyone have any experience and/or luck with drmaa<span><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>submitting / interacting with torque running on RHEL6.<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Trying to hook up a particular product (clcbio) with a torque/pbs server,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">it interacts through drmaa, which isn&#39;t working.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Long version:<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">We have a pair of servers (as opposed to a HPC cluster),<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">so for normal job submission from one host to another,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">we&#39;ve simply installed the RHEL6 packages for torque from the &#39;epel&#39; repository.<br>
(v. 2.5.7-9, e.g. torque-server-2.5.7-9.el6.x86_64)<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>On the submission host (client), I can submit jobs to (server)<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>using qsub<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>(Interactive jobs fail, but I can live with that for now - batch submission jobs succeed.)<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>Clcbio don&#39;t support torque/pbs, and I don&#39;t want to push that support burden onto this list,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>but what I would like to know is:<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>Has anyone has successfully configured/installed libdrmaa<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>to submit / interact with torque running on RHEL6?<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>Anyone have a simple wrapper script to call an external arbitrary libdrmaa library,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>as opposed to a perl/python library?<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>I&#39;m interested in testing someone else&#39;s libdrmaa functionality,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>not in using a better wheel.<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>Best regards,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>--Benji<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>Benji Wakely &lt;<a href="mailto:b.wakely@latrobe.edu.au" target="_blank">b.wakely@latrobe.edu.au</a>&gt;<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>Unix Systems Administrator<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>La Trobe University<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span><a href="tel:%2B613%209479%205499" value="+61394795499" target="_blank">+613 9479 5499</a><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span><a href="tel:%2B614%2034%20307%20667" value="+61434307667" target="_blank">+614 34 307 667</a><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
</div>

<br>_______________________________________________<br>
torqueusers mailing list<br>
<a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br>
<a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><b><span style="font-size:12pt;color:rgb(31,73,125)">Spencer Owen </span></b>| Technical Account Manager - Adaptive Support<br>


<font color="#999999">Direct Line:
</font><a value="+18017173380"><font color="#000066">801-341-4663</font></a><font color="#999999"> 
|  Fax: </font><a value="+18017173738" style="color:rgb(153,153,153)">801-717-3738</a><br>
<span style="color:rgb(166,166,166)">Address: 1712 S. East Bay
Blvd.
Suite 300  |  Provo, UT 84606</span>
</div>