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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Greetings,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">Short version:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Anyone have any experience and/or luck with drmaa<span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">submitting / interacting with torque running on RHEL6.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">Trying to hook up a particular product (clcbio) with a torque/pbs server,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">it interacts through drmaa, which isn't working.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">Long version:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">We have a pair of servers (as opposed to a HPC cluster),<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">so for normal job submission from one host to another,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">we've simply installed the RHEL6 packages for torque from the 'epel' repository.<br>
(v. 2.5.7-9, e.g. torque-server-2.5.7-9.el6.x86_64)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">On the submission host (client), I can submit jobs to (server)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">using qsub<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">(Interactive jobs fail, but I can live with that for now - batch submission jobs succeed.)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">Clcbio don't support torque/pbs, and I don't want to push that support burden onto this list,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">but what I would like to know is:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">Has anyone has successfully configured/installed libdrmaa<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">to submit / interact with torque running on RHEL6?<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">Anyone have a simple wrapper script to call an external arbitrary libdrmaa library,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">as opposed to a perl/python library?<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">I'm interested in testing someone else's libdrmaa functionality,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">not in using a better wheel.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">Best regards,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">--Benji<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">Benji Wakely &lt;b.wakely@latrobe.edu.au&gt;<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">Unix Systems Administrator<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">La Trobe University<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">&#43;613 9479 5499<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">&#43;614 34 307 667<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
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