if you want to use suraci, you cant ask for ppn=12 =(<div><br></div><div>Sorry...</div><div><br></div><div>you can ask for all nodes with 8 cores. and that would get you the 3 machines reserved, there yo ucan filter by hostname or IP which ones have 12 cores and use the 12, and use just 8 in suraci in you code or bash script.<br>

<br><div class="gmail_quote">On Mon, Feb 18, 2013 at 11:05 AM, Kamran Khan <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:kamran@pssclabs.com" target="_blank">kamran@pssclabs.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

<div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple"><div><p class="MsoNormal"><a name="13cee49f8dbff12a__MailEndCompose"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">Hi Ricardo,<u></u><u></u></span></a></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">Yeah, suraci is the pbsserver and has 4 cores not reserved for torque.<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">So I can specify ‘</span><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">#PBS -l nodes=n001+n002:ppn=12</span><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">‘, but can I also specify suraci?<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">That’s where I am getting a little confused because I have the 2 compute nodes with 12 available cores and the head node with only 8 available cores.<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">Is it at all possible to tell specific systems to use a specific amount of cores, or would I just have to lower the amount of cores being used on each system to 8?  Such as:<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">PBS -l nodes=3:ppn=8</span><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">Thanks in advance for your support.<u></u><u></u></span></p>

<div class="im"><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">--<u></u><u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">Kamran Khan<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">PSSC Labs<u></u><u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">Support Technician<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p></div><div style="border:none;border-top:solid #b5c4df 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">

<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;"> <a href="mailto:torqueusers-bounces@supercluster.org" target="_blank">torqueusers-bounces@supercluster.org</a> [mailto:<a href="mailto:torqueusers-bounces@supercluster.org" target="_blank">torqueusers-bounces@supercluster.org</a>] <b>On Behalf Of </b>Ricardo Román Brenes<br>

<b>Sent:</b> Friday, February 15, 2013 3:39 PM<br><b>To:</b> Torque Users Mailing List<br><b>Subject:</b> Re: [torqueusers] Torque job options<u></u><u></u></span></p></div><div><div class="h5"><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>

<p>hello! :-)<u></u><u></u></p><p>you can specify specific hosts with &quot;-l nodes=n001+n002&quot;.<u></u><u></u></p><p>that option will request both big nodes :-)<u></u><u></u></p><p>and on a side note if suraci has the pbsserver and has 8 cores, leave 1 or 2 reserved not for torque :-P<u></u><u></u></p>

<div><p class="MsoNormal">On Feb 15, 2013 5:07 PM, &quot;Kamran Khan&quot; &lt;<a href="mailto:kamran@pssclabs.com" target="_blank">kamran@pssclabs.com</a>&gt; wrote:<u></u><u></u></p><div><div><p class="MsoNormal">Hi Everyone,<u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">This is my first message to the community, so HIIIII!!<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p><div style="border:none;border-bottom:solid windowtext 1.0pt;padding:0in 0in 1.0pt 0in">

<p class="MsoNormal">Below is my torquetest.sh script which I use to test the functionality of torque across my cluster.<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p></div><p class="MsoNormal" style="text-autospace:none">

<span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">#!/bin/bash</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;"> </span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal" style="text-autospace:none">

<span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     #PBS -l walltime=00:1:00</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     #PBS -l nice=19</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     #PBS -q default</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     #PBS -l nodes=2:ppn=12</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;"> </span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">mpiexec -machinefile /opt/machinelist -np 24 hostname</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;"> </span><u></u><u></u></p><div style="border:none;border-bottom:solid windowtext 1.0pt;padding:0in 0in 1.0pt 0in"><p class="MsoNormal">

<span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">echo &quot;end&quot;</span><u></u><u></u></p></div><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p><div style="border:none;border-bottom:solid windowtext 1.0pt;padding:0in 0in 1.0pt 0in">

<p class="MsoNormal">And here is a copy of my pbsnodes output:<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p></div><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">suraci</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     state = free</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     <span style="color:red">np = 8</span></span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     ntype = cluster</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     status = rectime=1360968542,varattr=,jobs=,state=free,netload=<a href="tel:2013931431" target="_blank">2013931431</a>,gres=,loadave=1.00,ncpus=12,physmem=24562968kb,availmem=48500940kb,totmem=49728784kb,idletime=275,nusers=2,nsessions=2,sessions=18767 23996,uname=Linux <a href="http://icarus.beowulf6.actainc.com" target="_blank">icarus.beowulf6.actainc.com</a> 2.6.32-279.19.1.el6.x86_64 #1 SMP Sat Nov 24 14:35:28 EST 2012 x86_64,opsys=linux</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     mom_service_port = 15002</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     mom_manager_port = 15003</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;"> </span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">n001</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     state = free</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;;color:red">     np = 12</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     ntype = cluster</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     status = rectime=1360968542,varattr=,jobs=,state=free,netload=865146013,gres=,loadave=0.00,ncpus=12,physmem=24562968kb,availmem=49216676kb,totmem=49728784kb,idletime=81117,nusers=0,nsessions=0,uname=Linux <a href="http://n001.beowulf6.actainc.com" target="_blank">n001.beowulf6.actainc.com</a> 2.6.32-279.19.1.el6.x86_64 #1 SMP Sat Nov 24 14:35:28 EST 2012 x86_64,opsys=linux</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     mom_service_port = 15002</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     mom_manager_port = 15003</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;"> </span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">n002</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     state = free</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;;color:red">     np = 12</span><u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     ntype = cluster</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     status = rectime=1360968542,varattr=,jobs=,state=free,netload=647756235,gres=,loadave=1.00,ncpus=12,physmem=24562968kb,availmem=49226348kb,totmem=49728784kb,idletime=808775,nusers=0,nsessions=0,uname=Linux <a href="http://n002.beowulf6.actainc.com" target="_blank">n002.beowulf6.actainc.com</a> 2.6.32-279.19.1.el6.x86_64 #1 SMP Sat Nov 24 14:35:28 EST 2012 x86_64,opsys=linux</span><u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     mom_service_port = 15002</span><u></u><u></u></p><div style="border:none;border-bottom:solid windowtext 1.0pt;padding:0in 0in 1.0pt 0in"><p class="MsoNormal">

<span style="font-family:&quot;Courier New&quot;">     mom_manager_port = 15003</span><u></u><u></u></p></div><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">As you can see, ‘suraci’ has 8 free processors, while n001 and n002 have 12 free processors.  How do I establish these settings in my torquetest.sh?  Since I have 2 nodes with 12 and 1 node with 8.<u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">Does this make sense?<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">Thanks in advance.<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">--<u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal">Kamran Khan<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">PSSC Labs<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">Support Technician<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p></div></div><p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt">

<br>_______________________________________________<br>torqueusers mailing list<br><a href="mailto:torqueusers@supercluster.org" target="_blank">torqueusers@supercluster.org</a><br><a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><u></u><u></u></p>

</div></div></div></div></div><br>_______________________________________________<br>
torqueusers mailing list<br>
<a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br>
<a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>