<p dir="ltr">Sorry I meant procs!</p>
<div class="gmail_quote">On 7 Feb 2013 16:39, &quot;Andrew Dawson&quot; &lt;<a href="mailto:dawson@atm.ox.ac.uk">dawson@atm.ox.ac.uk</a>&gt; wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<p dir="ltr">Glen, I was just mentioning price for completeness really. As far as I can tell setting nodes should work...</p>
<div class="gmail_quote">On 7 Feb 2013 16:27, &quot;Glen Beane&quot; &lt;<a href="mailto:glen.beane@gmail.com" target="_blank">glen.beane@gmail.com</a>&gt; wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

On Thu, Feb 7, 2013 at 4:10 AM, Andrew Dawson &lt;<a href="mailto:dawson@atm.ox.ac.uk" target="_blank">dawson@atm.ox.ac.uk</a>&gt; wrote:<br>
&gt; Hi all,<br>
&gt;<br>
&gt; I&#39;m configuring a recent torque/maui installation and I&#39;m having trouble<br>
&gt; with submitting MPI jobs. I would like for MPI jobs to specify the number of<br>
&gt; processors they require and have those come from any available physical<br>
&gt; machine, the users shouldn&#39;t need to specify processors per node etc.<br>
&gt;<br>
&gt; The torque manual says that the nodes option is mapped to virtual<br>
&gt; processors, so for example:<br>
&gt;<br>
&gt;     #PBS -l nodes=8<br>
&gt;<br>
&gt; should request 8 virtual processors. The problem I&#39;m having is that our<br>
&gt; cluster currently has only 5 physical machines (nodes), and setting nodes to<br>
&gt; anything greater than 5 gives the error:<br>
&gt;<br>
&gt;     qsub: Job exceeds queue resource limits MSG=cannot locate feasible nodes<br>
&gt; (nodes file is empty or all systems are busy)<br>
&gt;<br>
&gt; I&#39;m confused by this, we have 33 virtual processors available across the 5<br>
&gt; nodes (4 8-core machines and one single core) so my interpretation of the<br>
&gt; manual is that I should be able to request 8 nodes, since these should be<br>
&gt; understood as virtual processors? Am I doing something wrong?<br>
&gt;<br>
&gt; I tried setting<br>
&gt;<br>
&gt; #PBS -l procs=8<br>
&gt;<br>
&gt; but that doesn&#39;t seem to do anything, MPI stops due to having only 1 worker<br>
&gt; available (single core allocated to the job).<br>
<br>
I don&#39;t think Maui correctly interprets procs.  You would need Moab.<br>
_______________________________________________<br>
torqueusers mailing list<br>
<a href="mailto:torqueusers@supercluster.org" target="_blank">torqueusers@supercluster.org</a><br>
<a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
</blockquote></div>
</blockquote></div>