<p>Ah thank you! I probably should have found that myself. I will test this out tomorrow.</p>
<div class="gmail_quote">On Feb 7, 2013 9:20 PM, &quot;Michel Béland&quot; &lt;<a href="mailto:michel.beland@calculquebec.ca">michel.beland@calculquebec.ca</a>&gt; wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Andrew Dawson wrote:<br>
<br>
&gt; From the torque documentation, it seems to say I can do:<br>
&gt;<br>
&gt; #PBS -l nodes=8<br>
&gt;<br>
&gt; and this will be interpreted as 8 CPUs rather than 8 physical nodes.<br>
&gt; This is what I want. Unfortunately I get the error message at<br>
&gt; submission time saying there are not enough resources to fulfill this<br>
&gt; request, even though there are 33 CPUs in the system. If on my system I do<br>
&gt;<br>
&gt; #PBS -l nodes=5<br>
&gt;<br>
&gt; then my MPI job gets sent to 5 CPUs, not necessarily on the same<br>
&gt; physical node, which is great and exactly what I want. I would<br>
&gt; therefore expect this to work for larger numbers but it seems that at<br>
&gt; submission time the request is checked against the number of physical<br>
&gt; nodes rather than virtual processors, meaning I cannot do this! It is<br>
&gt; quite frustrating.<br>
&gt;<br>
&gt; Please ask if there is further clarification I can make.<br>
<br>
According to<br>
<br>
<a href="http://docs.adaptivecomputing.com/torque/Content/topics/11-troubleshooting/faq.htm#qsubNotAllow" target="_blank">http://docs.adaptivecomputing.com/torque/Content/topics/11-troubleshooting/faq.htm#qsubNotAllow</a><br>

<br>
you have to set resources_available.nodect for the server and the queue<br>
in qmgr.<br>
<br>
I think that you also have to be careful with Maui/Moab configuration.<br>
You should make sure that you have<br>
<br>
JOBNODEMATCHPOLICY EXACTPROC<br>
<br>
<br>
in maui.cfg or moab.cfg.<br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
Michel Béland, analyste en calcul scientifique<br>
<a href="mailto:michel.beland@calculquebec.ca">michel.beland@calculquebec.ca</a><br>
bureau S-250, pavillon Roger-Gaudry (principal), Université de Montréal<br>
téléphone : <a href="tel:514%20343-6111" value="+15143436111">514 343-6111</a> poste 3892     télécopieur : <a href="tel:514%20343-2155" value="+15143432155">514 343-2155</a><br>
Calcul Québec (<a href="http://www.calculquebec.ca" target="_blank">www.calculquebec.ca</a>)<br>
Calcul Canada (<a href="http://calculcanada.ca" target="_blank">calculcanada.ca</a>)<br>
<br>
_______________________________________________<br>
torqueusers mailing list<br>
<a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br>
<a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
</blockquote></div>