<div dir="ltr">Hi David, <div><br></div><div>I have found that the temp files (.o and .e) are sent to /var/spool/PBS/spool but the output has only the first few lines my code print. I think this may have something to do with flushing the output. Could I be right. Also, I didn&#39;t understand what can I do about the file that should be generated by my code</div>

<div><br></div><div>Thank you very much for your time. <br><br><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
Yotam,<br>
<br>
If you have some kind of shared filesystem you may wish to look into the<br>
mom config parameter $spool_as_final_name. This has the mom write its<br>
output file directly to the location of the output file instead of<br>
spooling. This is documented in Appendix C.<br>
<br>
As far as finding the output for jobs that have already run - you may want<br>
to check the spool directories on the mother superior for the job (first<br>
node in the exec host list) and on the node that runs pbs_server.<br>
<br>
Cheers,<br>
<br>
David<br>
<br>
On Mon, Oct 29, 2012 at 7:54 AM, Yotam Avital &lt;<a href="mailto:yotama9@gmail.com">yotama9@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
<br>
&gt; Hi All.<br>
&gt;<br>
&gt; I&#39;m trying to run my simulations on a pbs cluster. I can submit the job<br>
&gt; but there is no output to the hard drive. My jobs are long (several weeks)<br>
&gt; and I need to know if the progression is good or there might be a bug<br>
&gt; somewhere. Also, the code should produce some files that are used for me to<br>
&gt; relaunch the run in an advanced state. Searching the user manual didn&#39;t<br>
&gt; produce any valuable information apart from that it&#39;s how pbs is<br>
&gt; configured.<br>
&gt;<br>
&gt; How can I get pbs to print output?<br>
&gt;<br>
&gt; Thanks.<br>
&gt;<br>
&gt; --<br>
&gt; My other email account has a &quot;professional&quot; signature.<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; _______________________________________________<br>
&gt; torqueusers mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br>
&gt; <a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
&gt;<br>
&gt;<br>
<br></blockquote></div>
</div></div>