Ok. Thanks for the help!<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 18, 2012 at 12:34 PM, Al Taufer <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ataufer@adaptivecomputing.com">ataufer@adaptivecomputing.com</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">It was not in the 2.4 version.  It first showed up sometime in the 2.5<br>
version and should be shown in the 2.5 man pages.<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Wed, Apr 18, 2012 at 10:20 AM, Ashish Agarwal &lt;<a href="mailto:agarwal1975@gmail.com">agarwal1975@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt; The slot limit is exactly what I&#39;m looking for, but:<br>
&gt;<br>
&gt; * It is not mentioned in our man pages. I read now the man page on<br>
&gt; <a href="http://clusterresources.com" target="_blank">clusterresources.com</a>, which is quite different than our installed man page.<br>
&gt;<br>
&gt; * It works on one of our clusters, but on a second one I get &quot;qsub: Bad Job<br>
&gt; Array Request.&quot; Does this feature have to be enabled? Or is it only<br>
&gt; available from a certain version? The cluster it works on is qsub version:<br>
&gt; 2.5.10, and the one it does not work on is version: 2.4.12.<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; On Wed, Apr 18, 2012 at 11:26 AM, Al Taufer &lt;<a href="mailto:ataufer@adaptivecomputing.com">ataufer@adaptivecomputing.com</a>&gt;<br>
&gt; wrote:<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; It sounds like slot limits on a job array would do what you want. The<br>
&gt;&gt; man page for qsub says<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; An optional slot limit can be specified to limit the amount  of jobs<br>
&gt;&gt; that  can  run concurrently in the job array. The default value is<br>
&gt;&gt; unlimited. The slot limit must be the last thing specified in the<br>
&gt;&gt; array_request and is delimited from the array by a percent sign (%).<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; qsub script.sh -t 0-299%5<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; This sets the slot limit to 5. Only 5 jobs from this array can run at<br>
&gt;&gt; the same time.<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; On Wed, Apr 18, 2012 at 8:22 AM, Ashish Agarwal &lt;<a href="mailto:agarwal1975@gmail.com">agarwal1975@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt;&gt; wrote:<br>
&gt;&gt; &gt; I&#39;ve read some posts about how an admin can limit the maximum number of<br>
&gt;&gt; &gt; jobs<br>
&gt;&gt; &gt; a user can run. But I&#39;d like to know if a user can him/herself limit the<br>
&gt;&gt; &gt; number of jobs *running*, ideally jobs within the same job array.<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt; The use case is that I would like to submit 500 I/O intensive jobs. Each<br>
&gt;&gt; &gt; job<br>
&gt;&gt; &gt; only requires a single core, so potentially all jobs could start running<br>
&gt;&gt; &gt; on<br>
&gt;&gt; &gt; our cluster overloading the storage system. Thus, I&#39;d like to say<br>
&gt;&gt; &gt; &quot;amongst<br>
&gt;&gt; &gt; all 500 jobs in this job array, run at most 20 at a time&quot;. Is that<br>
&gt;&gt; &gt; possible?<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt; Thank you.<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt; _______________________________________________<br>
&gt;&gt; &gt; torqueusers mailing list<br>
&gt;&gt; &gt; <a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br>
&gt;&gt; &gt; <a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; _______________________________________________<br>
&gt;&gt; torqueusers mailing list<br>
&gt;&gt; <a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br>
&gt;&gt; <a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; _______________________________________________<br>
&gt; torqueusers mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br>
&gt; <a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
&gt;<br>
_______________________________________________<br>
torqueusers mailing list<br>
<a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br>
<a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>