Hello,<br><br>Putting the code below in qsub wrapper would make torque recognize step change like 1-20:2 or 0-19:3, etc. This works only when -t is mentioned in the command line. I made my script recognize the same even when users mention it inside the script as well. But it&#39;s quite long. I guess once we find #PBS -t 2-23:3, we just have to make the script change it to #PBS -t 2,5,8,11,14,17,20,23. Which can be easily done with Andy&#39;s method of using seq.<br>

<br>Anyway, here is the code for wrapper for making it work with command line.<br><br>#!/bin/sh<br>args=(&quot;$@&quot;)<br>for((arg=0;arg&lt;$#;arg++))<br>do<br>    if [ &quot;${args[$arg]}&quot; = &quot;-t&quot; ]<br>    then    <br>

        if echo &quot;${args[$(($arg+1))]}&quot; | egrep &quot;^(^0|^[1-9][0-9]*)-[1-9][0-9]*:[1-9][0-9]*$&quot; &gt; /dev/null 2&gt;&amp;1<br>        then    <br>            array_arg=&quot;${args[$(($arg+1))]}&quot;<br>

            array_arg=&quot;$(seq -s, $(echo $array_arg | cut -f1 -d-) $(echo $array_arg | cut -f2 -d:) $(echo $array_arg | cut -f1 -d: | cut -f2 -d-))&quot;<br>            str=&quot;set -- \&quot;\${@:1:$(($arg+1))}\&quot; \&quot;${array_arg}\&quot; \&quot;\${@:$(($arg+3))}\&quot;&quot;<br>

            eval `echo &quot;$str&quot;` <br>            break   <br>        fi      <br>    fi      <br>done<br><br>In case you already have a wrapper in place, it doesn&#39;t do any harm to keep it at the beginning of it.<br>

<br>Sreedhar.<br><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Feb 8, 2012 at 9:47 AM, Ibad Kureshi U0850037 <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:U0850037@hud.ac.uk">U0850037@hud.ac.uk</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

Thanks Glen, Andy<br>
<br>
Andy: Nice!<br>
<br>
-Ibad<br>
<br>
<br>
________________________________________<br>
From: <a href="mailto:torqueusers-bounces@supercluster.org">torqueusers-bounces@supercluster.org</a> [<a href="mailto:torqueusers-bounces@supercluster.org">torqueusers-bounces@supercluster.org</a>] On Behalf Of Andrew Caird [<a href="mailto:acaird@umich.edu">acaird@umich.edu</a>]<br>


Sent: Wednesday, February 08, 2012 2:28 PM<br>
To: Torque Users Mailing List<br>
Subject: Re: [torqueusers] Step Change in Job Arrays<br>
<div class="im HOEnZb"><br>
On Wed, Feb 8, 2012 at 9:02 AM, Glen Beane &lt;<a href="mailto:glen.beane@gmail.com">glen.beane@gmail.com</a>&lt;mailto:<a href="mailto:glen.beane@gmail.com">glen.beane@gmail.com</a>&gt;&gt; wrote:<br>
On Wed, Feb 8, 2012 at 8:57 AM, Ibad Kureshi U0850037<br>
</div><div class="im HOEnZb">&lt;<a href="mailto:U0850037@hud.ac.uk">U0850037@hud.ac.uk</a>&lt;mailto:<a href="mailto:U0850037@hud.ac.uk">U0850037@hud.ac.uk</a>&gt;&gt; wrote:<br>
&gt; Hello,<br>
&gt;<br>
&gt; I was wondering is someone could tell me how to adjust the step size in a job array. We are running Torque 2.5.7 with the PBS_SCHEDD on a small cluster and our users want to submit arrays.<br>
&gt;<br>
&gt; One the SGE and the Moab/Torque based systems<br>
&gt;<br>
&gt; $ -t 1-20:2<br>
&gt;<br>
&gt; or<br>
&gt;<br>
&gt; #PBS -t 1-20:2<br>
&gt;<br>
&gt; respectively, gives them 10 jobs with even ID numbers.<br>
&gt;<br>
&gt; How can this be done with Torque? It throws out &quot;qsub: Bad Job Array Request&quot; error<br>
&gt;<br>
&gt; Have not been able to find much literature on this.<br>
&gt;<br>
&gt; Thanks<br>
<br>
<br>
this is not currently supported, but it is a great feature request.<br>
<br>
unfortunately the only option would be to explicitly specify each array ID:<br>
<br>
#PBS -t 2,4,6,8,10 ...20<br>
<br>
Or:<br>
<br>
  qsub -t `seq -s, 2 2 20` pbsfile.txt<br>
<br>
in case you don&#39;t want to type all the numbers.<br>
<br>
--andy<br>
<br>
<br>
</div><div class="im HOEnZb">---<br>
This transmission is confidential and may be legally privileged. If you receive it in error, please notify us immediately by e-mail and remove it from your system. If the content of this e-mail does not relate to the business of the University of Huddersfield, then we do not endorse it and will accept no liability.<br>


</div><div class="HOEnZb"><div class="h5">_______________________________________________<br>
torqueusers mailing list<br>
<a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br>
<a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><font style="font-family:arial,helvetica,sans-serif" size="2">Sreedhar Manchu<br>HPC Support Specialist<br>New York University<br>251 Mercer Street<br>New York, NY 10012-1110</font><br>

<br>