<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:tahoma, new york, times, serif;font-size:12pt"><div><span>ok thanks</span></div><div>&nbsp;</div><div><div><font style="BACKGROUND-COLOR:#ffffff;" face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0080ff" size="2"><b>// Naderan *Mahmood;</b></font></div></div><div><br></div><div style="font-family: tahoma, new york, times, serif; font-size: 12pt;"><div style="font-family: times new roman, new york, times, serif; font-size: 12pt;"><font face="Arial" size="2"><hr size="1"><b><span style="font-weight:bold;">From:</span></b> Glen Beane &lt;glen.beane@gmail.com&gt;<br><b><span style="font-weight: bold;">To:</span></b> Mahmood Naderan &lt;nt_mahmood@yahoo.com&gt;; Torque Users Mailing List &lt;torqueusers@supercluster.org&gt;<br><b><span style="font-weight: bold;">Sent:</span></b> Thursday, August 4, 2011 8:05 PM<br><b><span style="font-weight: bold;">Subject:</span></b> Re: [torqueusers]
 question about submitting multiple jobs (a.k.a job array)<br></font><br><div id="yiv1979085954"><br><br><div class="yiv1979085954gmail_quote">On Thu, Aug 4, 2011 at 11:33 AM, Glen Beane <span dir="ltr">&lt;<a rel="nofollow" ymailto="mailto:glen.beane@gmail.com" target="_blank" href="mailto:glen.beane@gmail.com">glen.beane@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="yiv1979085954gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<div class="yiv1979085954im"><br><br><div class="yiv1979085954gmail_quote">On Thu, Aug 4, 2011 at 7:44 AM, Mahmood Naderan <span dir="ltr">&lt;<a rel="nofollow" ymailto="mailto:nt_mahmood@yahoo.com" target="_blank" href="mailto:nt_mahmood@yahoo.com">nt_mahmood@yahoo.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="yiv1979085954gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">

Hi<br>
I am looking for some example to submit multiple jobs as stated in <a rel="nofollow" target="_blank" href="http://www.clusterresources.com/torquedocs21/2.1jobsubmission.shtml#jobarrays">http://www.clusterresources.com/torquedocs21/2.1jobsubmission.shtml#jobarrays</a><br>


<br>
For example, I have to jobs:<br>
job1 &gt;&gt;<br>
#PBS -q Q1<br>
cd $PBS_O_WORKDIR<br>
./run -bench1<br>
<br>
job2 &gt;&gt;<br>
#PBS -q Q2<br>
cd $PBS_O_WORKDIR<br>
./run -bench2<br>
<br>
Normally I use<br>
<br>
qsub job1<br>
qsub job2<br>
<br>
<br>
Now I want to submit them with one qsub command.<br>
It is stated that I have to use "qsub -t 0-1 submit_script.sh"<br>
I want to know what is the content of "submit_script.sh" ?<br>
Is it<br>
<br>
#PBS -q Q1<br>
cd $PBS_O_WORKDIR<br>
./run -bench1#PBS -q Q2<br>
cd $PBS_O_WORKDIR<br>
./run -bench2<br></blockquote></div><br><br></div>#PBS -q Q1<br>#PBS -t 1-2<br><br>cd $PBS_O_WORKDIR<br>./run -bench${PBS_ARRAYID}<br><br><br>notice I passed 1-2 for the -t argument.&nbsp; This means one job will be run with a PBS_ARRAYID of 1, and the other of 2.&nbsp; <br>

<br>
</blockquote></div><br>or if you pass -t on the command line to qsub...<br><br>#PBS -q Q1<br><br>cd $PBS_O_WORKDIR<br><br>./run -bench${PBS_ARRAYID}<br><br>and submit with qsub -t 1-2 submit_script.sh<br><br>The key thing to remember is each job in the job array runs the exact same script.&nbsp; You use the $PBS_ARRAYID variable to take a different action <br>
</div><br><br></div></div></div></body></html>