<html><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-15"><META name="Author" content="Novell GroupWise WebAccess"></head><body style='font-family: Tahoma, sans-serif; font-size: 13px; '>I realized I could not send you the txt-attachements. Here are some of the stuff:<br><br><br>************************************<br>qstat.log:<br>Job Id: 101.super1<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Job_Name = scr.sh<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Job_Owner = jakob@super1<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; resources_used.cput = 00:00:00<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; resources_used.mem = 0kb<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; resources_used.vmem = 0kb<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; resources_used.walltime = 00:00:01<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; job_state = C<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; queue = batch<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; server = super1<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Checkpoint = u<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; ctime = Mon Mar&nbsp; 7 12:03:57 2011<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Error_Path = super1:/home/jakob/TEST/scr.sh.e101<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; exec_host = super1/2+super1/1+super1/0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Hold_Types = n<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Join_Path = n<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Keep_Files = n<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Mail_Points = abe<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Mail_Users = jakob.blomqvist@mah.se<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; mtime = Mon Mar&nbsp; 7 12:03:58 2011<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Output_Path = super1:/home/jakob/TEST/scr.sh.o101<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Priority = 0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; qtime = Mon Mar&nbsp; 7 12:03:57 2011<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Rerunable = True<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Resource_List.ncpus = 1<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Resource_List.neednodes = 1:ppn=3<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Resource_List.nodect = 1<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Resource_List.nodes = 1:ppn=3<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Resource_List.walltime = 00:05:00<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; session_id = 7686<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; substate = 59<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Variable_List = PBS_O_HOME=/home/jakob,PBS_O_LANG=en_US.UTF-8,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; PBS_O_LOGNAME=jakob,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; PBS_O_PATH=/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/b<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; in:/usr/games:/home/jakob/scripts:/usr/local/bin/FullProf_Suite:,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; PBS_O_MAIL=/var/mail/jakob,PBS_O_SHELL=/bin/bash,PBS_O_HOST=super1,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; PBS_SERVER=super1,PBS_O_WORKDIR=/home/jakob/TEST,PBS_O_QUEUE=batch<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; euser = jakob<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; egroup = jakob<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; hashname = 101.super1<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; queue_rank = 13<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; queue_type = E<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; comment = Job started on Mon Mar 07 at 12:03<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; etime = Mon Mar&nbsp; 7 12:03:57 2011<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; exit_status = 0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; submit_args = scr.sh<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; start_time = Mon Mar&nbsp; 7 12:03:57 2011<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; start_count = 1<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; fault_tolerant = False<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; comp_time = Mon Mar&nbsp; 7 12:03:58 2011<br>**************************************<br><br>**************************************<br>server_log.file:<br><br>03/07/2011 12:16:25;0100;PBS_Server;Job;102.super1;enqueuing into batch, state 1 hop 1<br>03/07/2011 12:16:25;0008;PBS_Server;Job;102.super1;Job Queued at request of jakob@super1, owner = jakob@super1, job name = scr.sh, queue = batch<br>03/07/2011 12:16:25;0040;PBS_Server;Svr;super1;Scheduler was sent the command new<br>03/07/2011 12:16:25;0008;PBS_Server;Job;102.super1;Job Modified at request of Scheduler@super1<br>03/07/2011 12:16:25;0008;PBS_Server;Job;102.super1;Job Run at request of Scheduler@super1<br>03/07/2011 12:16:25;0040;PBS_Server;Svr;super1;Scheduler was sent the command recyc<br>03/07/2011 12:16:25;0010;PBS_Server;Job;102.super1;Exit_status=0 resources_used.cput=00:00:00 resources_used.mem=0kb resources_used.vmem=0kb resources_used.walltime=00:00:00<br>03/07/2011 12:16:25;0040;PBS_Server;Svr;super1;Scheduler was sent the command term<br>03/07/2011 12:17:05;0002;PBS_Server;Svr;PBS_Server;Torque Server Version = 2.4.3, loglevel = 0<br>03/07/2011 12:17:25;0100;PBS_Server;Job;102.super1;dequeuing from batch, state COMPLETE<br>03/07/2011 12:17:25;0040;PBS_Server;Svr;super1;Scheduler was sent the command term<br>03/07/2011 12:22:05;0002;PBS_Server;Svr;PBS_Server;Torque Server Version = 2.4.3, loglevel = 0<br>03/07/2011 12:27:05;0002;PBS_Server;Svr;PBS_Server;Torque Server Version = 2.4.3, loglevel = 0<br>03/07/2011 12:27:25;0040;PBS_Server;Svr;super1;Scheduler was sent the command time<br>****************************************<br><br>****************************************<br>scr.sh:<br><br><br>!/bin/sh<br>#PBS -l nodes=1:ppn=3<br>#PBS -l walltime=0:5:00<br>#PBS -m abe<br>#PBS -M xxx.xxx@xxx.se<br><br>cd $PBS_O_WORKDIR<br>echo "This is workdir"<br>echo `pwd`<br>echo mail location is `which mail`<br>***************************************<br><br>***************************************<br>scr.sh.o102:<br><br>This is workdir<br>/home/jakob/TEST<br>mail location is /usr/bin/mail<br>***************************************<br><br><br><br><br><br/><div style='clear: both;'>Dr. Jakob Blomquist<br>IMP, School of Technology<br>Malmo University<br>SWEDEN<br>+46(0)40 6657626<br>jakob.blomqvist@mah.se</div><br/>&gt;&gt;&gt; David Beer &lt;dbeer@adaptivecomputing.com&gt; 03/03/11 7:05 PM &gt;&gt;&gt;<br><br>----- Original Message -----<br>&gt; Hi,<br>&gt; I have set up Torque-2.4.3 (Server, MOM and Sched) on a single node,<br>&gt; 16 core AMD machine for scientific calculations, with Ubuntu 10.10<br>&gt; installed. The machine has a permanent ip address within a university<br>&gt; network. It is accessed to by ssh. I finally managed to get the qsub<br>&gt; to work, however email notification will not work. My ./configure was<br>&gt; following:<br>&gt; $ ./configure --disable-gcc-warnings<br>&gt; --with-server-home=/var/spool/pbs/ --with-sendmail=mail<br>&gt; followed by<br>&gt; $ make -j 16<br>&gt; and<br>&gt; $ sudo make install<br>&gt; <br>&gt; I have mailx installed configured to use university outgoing<br>&gt; smpt-domain and following command make me receive a testmail in my<br>&gt; mailbox:<br>&gt; $ mail -s 'test message' XXXX.XXXX@XXX.se &lt; /dev/null<br>&gt; <br>&gt; I don't even know where to see if torque tried to send mail at all.<br>&gt; Obviously I use the -m flag and set a mail using -M. But no luck.<br>&gt; <br>&gt; Dr. Jakob Blomquist<br>&gt; IMP, School of Technology<br>&gt; Malmo University<br>&gt; SWEDEN<br>&gt; +46(0)40 6657626<br>&gt; jakob.blomqvist@mah.se<br>&gt; <br><br>Jakob,<br><br>I would check for errors in the pbs_server's log file. You could serach the file for a job id that didn't send the job or look for svr_mailowner.<br><br>Cheers,<br><br>-- <br>David Beer <br>Direct Line: 801-717-3386 | Fax: 801-717-3738<br>     Adaptive Computing<br>     1656 S. East Bay Blvd. Suite #300<br>     Provo, UT 84606<br><br>_______________________________________________<br>torqueusers mailing list<br>torqueusers@supercluster.org<br>http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers<br></body></html>