I&#39;ll try both solutions. Thanks for help guys.<br><br><div class="gmail_quote">2010/12/9 Gus Correa <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:gus@ldeo.columbia.edu">gus@ldeo.columbia.edu</a>&gt;</span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
<div class="im">Troy Baer wrote:<br>
&gt; On Thu, 2010-12-09 at 12:08 +0100, Guille wrote:<br>
&gt;&gt; How i can make a PBS script to make him wait to run till another job<br>
&gt;&gt; in the same qeue has finished.<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; I mean for exemple: on queue1 i have job1 running, and i want to job2<br>
&gt;&gt; to wait till job1 has finished to be executed.<br>
&gt;<br>
&gt; Please take a look at the qsub man page, specifically the section about<br>
&gt; -W depend=.<br>
&gt;<br>
&gt;       --Troy<br>
<br>
</div>Hi Guille<br>
<br>
Besides the -W depend=[afterok, etc] that Troy suggests,<br>
if you are running a series of jobs where the new one<br>
continues the work done by the previous, you may<br>
resubmit the job from your Torque/PBS script,<br>
instead of queuing up the whole series at once.<br>
<br>
Something like this:<br>
<br>
#PBS ...<br>
...<br>
mpirun -np 32 ./myprogram<br>
...<br>
qsub myjob.pbs (or qsub $0)<br>
exit<br>
<br>
<br>
To make this work, first you need to do:<br>
<br>
qmgr -c &#39;set server allow_node_submit = True&#39;<br>
<br>
if this server attribute is not yet set this way.<br>
<br>
<br>
We use both mechanisms here, depending on what is needed.<br>
<br>
My two cents,<br>
<font color="#888888">Gus Correa<br>
</font><div><div></div><div class="h5"><br>
_______________________________________________<br>
torqueusers mailing list<br>
<a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br>
<a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>