I&#39;ve tried that, unfortunately I never get a $PBS_NODEFILE that spans more than one node.<br clear="all"><br>-- max(∫(εὐδαιμονία)dt)<br><br>Dr Gordon Wells<br>Bioinformatics and Computational Biology Unit<br>Department of Biochemistry<br>
University of Pretoria<br>
<br><br><div class="gmail_quote">On 7 October 2010 10:02, Vaibhav Pol <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:vaibhavp@cdac.in">vaibhavp@cdac.in</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
 Hi ,<br>
 you must set server as well as queue attribute.<br>
<br>
         set server resources_available.nodect = (number of  nodes * cpus per node)<br>
         set &lt;queue name&gt; resources_available.nodect = (number of  nodes * cpus per node)<br>
<br>
<br>
 Thanks and regards,<br>
 Vaibhav Pol<br>
 National PARAM Supercomputing Facility<br>
 Centre for Development of Advanced Computing<br>
 Ganeshkhind Road<br>
 Pune University Campus<br>
 PUNE-Maharastra<br>
 Phone +91-20-25704176 ext: 176<br>
 Cell Phone :  +919850466409<div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
<br>
On Thu, 7 Oct 2010, Gordon Wells wrote:<br>
<br>
</div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div></div><div class="h5">
Hi<br>
<br>
I&#39;ve now tried torque 2.5.2 as well, same problems.<br>
Setting resources_available.nodect has no effect except allowing me to use<br>
&quot;-l nodes=x&quot; with x &gt; 14<br>
<br>
regards<br>
<br>
-- max(∫(εὐδαιμονία)dt)<br>
<br>
Dr Gordon Wells<br>
Bioinformatics and Computational Biology Unit<br>
Department of Biochemistry<br>
University of Pretoria<br>
<br>
<br>
On 6 October 2010 20:04, Glen Beane &lt;<a href="mailto:glen.beane@gmail.com" target="_blank">glen.beane@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
On Wed, Oct 6, 2010 at 1:12 PM, Gordon Wells &lt;<a href="mailto:gordon.wells@gmail.com" target="_blank">gordon.wells@gmail.com</a>&gt;<br>
wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Can I confirm that this will definitely fix the problem? Unfortunately<br>
</blockquote>
this<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
cluster also needs to be glite compatible, 2.3.6 seems to be the latest<br>
</blockquote>
that<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
will work<br>
</blockquote>
<br>
<br>
i&#39;m not certain...  do you happen to have set server<br>
resources_available.nodect set?  I have seen bugs with PBS_NODEFILE<br>
contents when this server attribute is set.  This may be a<br>
manifestation of this bug, and I&#39;m not sure if it has been corrected.<br>
<br>
try unsetting this and submitting a job with -l nodes=X:ppn=Y<br>
_______________________________________________<br>
torqueusers mailing list<br>
<a href="mailto:torqueusers@supercluster.org" target="_blank">torqueusers@supercluster.org</a><br>
<a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
<br>
</blockquote>
<br></div></div>
-- <br>
This message has been scanned for viruses and<br>
dangerous content by MailScanner, and is<br>
believed to be clean.<br>
<br>
<br>
</blockquote>
-- <br>
This message has been scanned for viruses and<br>
dangerous content by MailScanner, and is<br>
believed to be clean.<br>
<br>
<br>_______________________________________________<br>
torqueusers mailing list<br>
<a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br>
<a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers" target="_blank">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br>
<br></blockquote></div><br>