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<div class="Section1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D">Could you show us whats in the
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D">$PBS_HOME/server_priv/nodes file<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D">($PBS_HOME is typlically /var/spool/pbs/)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D">Regards<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D">-Ibad<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;
color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;"> torqueusers-bounces@supercluster.org [mailto:torqueusers-bounces@supercluster.org]
<b>On Behalf Of </b>Gordon Wells<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, October 06, 2010 9:38 AM<br>
<b>To:</b> torqueusers@supercluster.org<br>
<b>Subject:</b> [torqueusers] PBS_NODEFILE incomplete (entries for last(?) node only)<o:p></o:p></span></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal">Hi<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">I'm having trouble running mpi jobs when &nbsp;nodes=x with x greater than the number of cores per node. The system comprises 14 nodes with 8 cores/cpus each. When x &gt; 8 it seems to only have entries for the last node, ie 4 lines if I use &quot;-l
 nodes=12&quot;. I've tried various combinations with &quot;nodes=x:ppn=y&quot; as well, no luck. What could be wrong?<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Thanks in advance<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Gordon<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><br>
-- max(∫(ε<span style="font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;">ὐ</span>δαιμονία)dt)<br>
<br>
Dr Gordon Wells<br>
Bioinformatics and Computational Biology Unit<br>
Department of Biochemistry<br>
University of Pretoria<o:p></o:p></p>
</div>
<br>
<hr>
<font face="Arial" color="Gray" size="1"><br>
---<br>
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