<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 TRANSITIONAL//EN">
<HTML>
<HEAD>
  <META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; CHARSET=UTF-8">
  <META NAME="GENERATOR" CONTENT="GtkHTML/3.28.3">
</HEAD>
<BODY>
Hello,<BR>
<BR>
A user is experience an apparently random issue with the Torque/PDB scheduler delaying execution of jobs, even when adequate resources are available.&nbsp; <BR>
<BR>
He will submit a batch of 50 or 100 small jobs simultaneously (in a single script). Sometimes all 50 or 100 jobs will run.&nbsp; At other times several jobs will be held until the other finish (just a few minutes).&nbsp; This does not seem to relate to the available resources: there is not a conflict with other jobs queued or running.<BR>
<BR>
<BR>
Has anyone else experienced this, know what the cause and solution to the problem might be?<BR>
<BR>
System:<BR>
torque 2.1.9-1<BR>
CentOS 5.2<BR>
120 processor cluster (15 boxes, 64 bit dual quad-core opterons)<BR>
<BR>
<TABLE CELLSPACING="0" CELLPADDING="0" WIDTH="100%">
<TR>
<TD>
<TABLE CELLSPACING="0" CELLPADDING="0" WIDTH="100%">
<TR>
<TD>
Yours sincerely,<BR>
<BR>
Mark A. White, Ph.D.<BR>
Associate Professor of Biochemistry and Molecular Biology, <BR>
Manager, Sealy Center for Structural Biology and Molecular Biophysics X-ray Crystallography Laboratory,<BR>
Basic Science Building, Room 6.660 C<BR>
University of Texas Medical Branch<BR>
Galveston, TX 77555-0647<BR>
Tel. (409) 747-4747<BR>
Cell. (281) 734-3614<BR>
Fax. (409) 747-1404<BR>
mailto://mawhite@utmb.edu<BR>
http://xray.utmb.edu<BR>
http://xray.utmb.edu/~white
</TD>
</TR>
</TABLE>
</TD>
</TR>
</TABLE>
</BODY>
</HTML>