<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hello all,<div>Am I getting the wrong end of the stick with the DRMAA Native Specification attribute? I can submit jobs to TORQUE quite cheerfully with DRMAA, unless I want to set any options that aren't part of the DRMAA specification, like choosing a queue or using more than one node. To do that, AFAIK, you use the native specification or the job category attribute. The latter requires the admin to set things up, but the former provides a string that is passed through to the underlying DRM. I presumed that this uses the same format as the command line options for qsub, but it doesn't seem to be working (see example below) - the job submits fine, but all the options in the native specification are ignored. Is it using a different format?</div><div><br></div><div>Regards,</div><div>Scott</div><div><br></div><div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 11px/normal Monaco; color: rgb(79, 144, 116); "></div><blockquote type="cite"><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 11px/normal Monaco; color: rgb(79, 144, 116); "><span style="color: #000000">session.init(</span><span style="color: #3e3df9">""</span><span style="color: #000000">);</span></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 11px/normal Monaco; "><span style="text-decoration: underline">JobTemplate</span> job = session.createJobTemplate();</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 11px/normal Monaco; ">job.setRemoteCommand(<span style="color: #3e3df9">"/bin/sleep"</span>);</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 11px/normal Monaco; ">List&lt;String&gt; arguments = <span style="color: #921a66">new</span> LinkedList&lt;String&gt;();</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 11px/normal Monaco; ">arguments.add(<span style="color: #3e3df9">"30"</span>);</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 11px/normal Monaco; ">job.setArgs(arguments);</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 11px/normal Monaco; ">job.setJobName(<span style="color: #3e3df9">"DRMAATest"</span>);</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 11px/normal Monaco; ">job.setBlockEmail(<span style="color: #921a66">true</span>);</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 11px/normal Monaco; ">job.setNativeSpecification(<span style="color: #3e3df9">"-q workqueue -l nodes=2:ppn=4"</span>);</div><p style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px; font: 11.0px Monaco; min-height: 15.0px"><br class="webkit-block-placeholder"></p><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 11px/normal Monaco; ">String jobIdentifier = session.runJob(job);</div></blockquote></div><div><div>
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div><br class="Apple-interchange-newline"><br></div><div><div><span class="Apple-style-span" style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; "><b><font color="#ff6600">Scott Wilson</font></b></span></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: arial, sans-serif; color: rgb(34, 34, 34); font-size: 13px; "><font color="#666666"><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">Developer</span></font></font><br><b><font color="#ff6600"><font class="Apple-style-span" face="Arial" size="2"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 10px; ">Epistemy</span></font></font></b><br><font size="1"><font color="#666666">Energy Academy</font></font><br><font size="1"><font color="#666666">Riccarton</font></font><br><font size="1"><font color="#666666">EH14 4AS</font></font><br><br><b><font size="1"><font color="#666666">tel:&nbsp;</font></font></b><font color="#666666"><font size="1">+44 131 564 0232</font></font><br><font color="#888888"><font size="1"><a href="mailto://scott.wilson@epistemy.com" target="_blank" style="color: rgb(53, 66, 88); ">Scott.Wilson@epistemy.com</a></font><br><font size="1"><a href="http://www.epistemy.com/" target="_blank" style="color: rgb(53, 66, 88); ">http://www.epistemy.com/</a></font><br><font size="1"><font color="#666666">Epistemy Limited is a company registered in Scotland, number SC365481.</font></font><br><font size="1"><font color="#666666">Registered office: Epistemy Limited c/o Technology and Research Services, Heriot-Watt University, Riccarton, Edinburgh, EH14 4AS</font></font></font></span></div></div></span></div></span></div>
</div>
<br></div></body></html>