<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7654.12">
<TITLE>Re: [torqueusers] problem getting files copied</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE-----<BR>
Hash: SHA1<BR>
<BR>
On 08/07/10 23:05, Andreas Davour wrote:<BR>
<BR>
&gt; Looking in /var/spool/torque I find nothing looking like<BR>
&gt; ER or OU files or any uncopied files in the undelivered<BR>
&gt; directory.<BR>
<BR>
Your job isn't getting far enough for that to happen<BR>
would be my guess.<BR>
<BR>
&gt; On the only node inline the mom log say:<BR>
&gt; 07/08/2010 14:52:09;0001;&nbsp;&nbsp; pbs_mom;Job;TMomFinalizeJob3;start failed,<BR>
&gt; improper sid<BR>
<BR>
In your syslog you will likely see something like:<BR>
<BR>
&quot;read of pipe for sid failed for job %s (%d of %d bytes)&quot;<BR>
<BR>
as that's the error right before the &quot;improper sid&quot; report.<BR>
<BR>
The test that is failing is:<BR>
<BR>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; if (ReadSize != sizeof(sjr))<BR>
<BR>
where ReadSize is passed into the function TMomFinalizeJob3<BR>
and sjr is defined as:<BR>
<BR>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; struct startjob_rtn sjr;<BR>
<BR>
I don't know this area of code, so would need to dig a bit<BR>
deeper, but I presume the problem is occuring before that<BR>
to cause ReadSize to not match it.<BR>
<BR>
cheers,<BR>
Chris<BR>
- --<BR>
&nbsp;Christopher Samuel - Senior Systems Administrator<BR>
&nbsp;VLSCI - Victorian Life Sciences Computational Initiative<BR>
&nbsp;Email: samuel@unimelb.edu.au Phone: +61 (0)3 903 55545<BR>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <A HREF="http://www.vlsci.unimelb.edu.au/">http://www.vlsci.unimelb.edu.au/</A><BR>
<BR>
-----BEGIN PGP SIGNATURE-----<BR>
Version: GnuPG v1.4.10 (GNU/Linux)<BR>
Comment: Using GnuPG with Mozilla - <A HREF="http://enigmail.mozdev.org/">http://enigmail.mozdev.org/</A><BR>
<BR>
iEYEARECAAYFAkw2gh8ACgkQO2KABBYQAh80jgCfcLZW6RFQeI9eHNMEYWLfj8wL<BR>
olEAoJYeNjlL7ESzNbovZTxqkiWmBMHF<BR>
=2cm/<BR>
-----END PGP SIGNATURE-----<BR>
</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>