<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi,<div><br></div><div>I just have one comment. Please see below.</div><div><br><div><div>On May 28, 2008, at 9:58 AM, Martins, Flavio wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0; "><div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="place"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="PostalCode"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="State"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="City"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="Street"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="address"><div class="Section1"><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">Thanks to all who responded. I think I have made some progress with this issue, although I still have not gotten it to work. I will try to address most of the comments made all at once here:<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">1) I can run any X application on my master (login) node without any problems. If I ssh –X into the cluster the $DISPLAY variable is set to something like localhost:12. If I rlogin I have to manually set $DISPLAY to workstation:0.0.<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">2) I think the –X from qsub does not work for me because I don’t have ssh running on the nodes. Our cluster has a very bare-bones setup for the nodes and ssh is not part of the node configuration. I also don’t have X running on the nodes – although I don’t think that’s necessary if I am forwarding the display elsewhere.</span></font></div></div></o:smarttagtype></o:smarttagtype></o:smarttagtype></o:smarttagtype></o:smarttagtype></o:smarttagtype></div></span></blockquote><div><br></div>qsub does not use SSH to start remote X applications. It uses X-forwarding, but does not require SSH, but uses its own Task Manager to start jobs in the compute nodes.</div><div><br><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0; "><div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="place"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="PostalCode"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="State"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="City"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="Street"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="address"><div class="Section1"><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p>&nbsp;<span class="Apple-style-span" style="color: rgb(20, 79, 174); font-size: 12px; -webkit-text-stroke-width: -1; ">3) I tried to rlogin to the master node, set the DISPLAY variable to workstation:0.0 and issue a qsub –I –V. Once on the node, I checked the value of the DISPLAY variable and it was set to “workstation”. It had lost the :0.0 part. I tried to set again manually but it did not work. Launching an X application just hangs. I can ping my workstation from the node, and I had access control disabled (vial xhost + command).</span></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">4) if I rlogin, set the DISPLAY manually to workstation:0.0 and then issue a qsub –I –X, the DISPLAY variable gets set to localhost:50 once on the node, and X applications just hang.<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">I think the best course of action at this point is to configure the nodes to run ssh. I have discussed this issue with the developer of our cluster software and he said that although this is possible he would not recommend it as the applications would run very slow. Is that consistent with the experience of others?<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="6" color="blue" face="Bookman Old Style"><span style="font-size: 24pt; font-family: 'Bookman Old Style'; color: blue; ">Flavio Martins</span></font><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><i><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; font-style: italic; ">Senior Engineer - Aerodynamics / CFD</span></font><o:p></o:p></i></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><strong><b><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">Florida Turbine Technologies Inc.</span></font></b></strong><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><st1:street w:st="on"><st1:address tabindex="0" w:st="on" style="background-image: url(res://ietag.dll/#34/%231001); background-repeat: repeat-x; background-position: 0% 100%; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">1701 Military Trail, Suite 110</span></font></st1:address></st1:street><o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><st1:place w:st="on"><st1:city w:st="on"><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">Jupiter</span></font></st1:city><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">,<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><st1:state w:st="on">FL</st1:state><span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><st1:postalcode w:st="on">33458-7101</st1:postalcode></span></font></st1:place></div></div></o:smarttagtype></o:smarttagtype></o:smarttagtype></o:smarttagtype></o:smarttagtype></o:smarttagtype></div></span></blockquote><br></div><div>Prakash</div><div><br></div><div> <span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>Prakash Velayutham</div><div>Programmer / Analyst</div><div>Cincinnati Children's Hospital Medical Center</div></div></span></div></span></div></span></div></span> </div><br></div></body></html>