<br><br><div class="gmail_quote">On Nov 30, 2007 12:55 PM, Gabe Turner &lt;<a href="mailto:gabe@msi.umn.edu">gabe@msi.umn.edu</a>&gt; wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div class="Ih2E3d">On Fri, Nov 30, 2007 at 12:40:02PM -0500, Sean Davis wrote:<br>&gt; &nbsp; &nbsp;I have a simple cluster (two nodes for now) set up and running using<br>&gt; &nbsp; &nbsp;pbs_sched. &nbsp;I submit the following using qsub as a script:
<br>&gt;<br>&gt; &nbsp; &nbsp;#!/bin/bash<br>&gt; &nbsp; &nbsp;# --- send the job to 4 nodes, with 2 processors per node<br>&gt; &nbsp; &nbsp;# PBS -l nodes=2:ppn=4<br></div> &nbsp; &nbsp; &nbsp;^<br> &nbsp; &nbsp; &nbsp;^<br>That space right there is going to prevent torque from recognizing that as
<br>a resource request. &nbsp;It will just ignore it as a comment.<br></blockquote><div><br>Thanks, Gabe.&nbsp; Fixed that.&nbsp; Now, with the corrected script:<br>#!/bin/bash<br># --- send the job to 2 nodes, with 4 processors per node
<br>#PBS -l nodes=2:ppn=4<br>....<br><br>I get:<br><br>sdavis@shakespeare:~&gt; qsub stuff.sh<br><a href="http://555.shakespeare.nci.nih.gov">555.shakespeare.nci.nih.gov</a><br>sdavis@shakespeare:~&gt; more test.out<br><a href="http://shakespeare.nci.nih.gov">
shakespeare.nci.nih.gov</a><br><a href="http://shakespeare.nci.nih.gov">shakespeare.nci.nih.gov</a><br><a href="http://shakespeare.nci.nih.gov">shakespeare.nci.nih.gov</a><br><a href="http://shakespeare.nci.nih.gov">shakespeare.nci.nih.gov
</a><br>Print out the hostname and date<br>shakespeare<br>Fri Nov 30 12:59:01 EST 2007<br><br>I would have expected something like this (which I get with the node names specified):<br><br>sdavis@shakespeare:~&gt; qsub stuff.sh
<br><a href="http://556.shakespeare.nci.nih.gov">556.shakespeare.nci.nih.gov</a><br>sdavis@shakespeare:~&gt; more test.out<br><a href="http://pressa.nci.nih.gov">pressa.nci.nih.gov</a><br><a href="http://pressa.nci.nih.gov">
pressa.nci.nih.gov</a><br><a href="http://pressa.nci.nih.gov">pressa.nci.nih.gov</a><br><a href="http://pressa.nci.nih.gov">pressa.nci.nih.gov</a><br><a href="http://shakespeare.nci.nih.gov">shakespeare.nci.nih.gov</a><br>
<a href="http://shakespeare.nci.nih.gov">shakespeare.nci.nih.gov</a><br><a href="http://shakespeare.nci.nih.gov">shakespeare.nci.nih.gov</a><br><a href="http://shakespeare.nci.nih.gov">shakespeare.nci.nih.gov</a><br>Print out the hostname and date
<br>pressa<br>Fri Nov 30 13:03:15 EST 2007<br><br>Shakespeare is the submit host, the server, and is also a compute node.<br><br>Thanks again,<br>Sean<br><br></div></div><br>