<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi Samir,<div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div>If all you want to do is remove this job from the system,</div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div>1) Login to the compute node(s) where the job is running and remove everything (files and folders) that have the name as in the job id from $PBS_HOME/mom_priv/jobs folder.</div><div>2) Also make sure to kill any processes that have been started by the above job on the nodes.</div><div>3) In the headnode, do the same under the folder $PBS_HOME/server_priv/jobs.</div><div>4) Restart both the mom (on the relevant nodes) and the server on the headnode.</div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div>You should not see the job listed anymore and the job is killed.</div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div>Prakash</div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div><div><div>On Nov 7, 2007, at 8:53 PM, Samir Khanal wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0; "><div bgcolor="#ffffff"><div><font face="Arial" size="2">Hi</font></div><div><font face="Arial" size="2"></font>&nbsp;</div><div><font face="Arial" size="2">I submitted a job using QSUB on the PBS</font></div><div><font face="Arial" size="2"></font>&nbsp;</div><div><font face="Arial" size="2">But the message below says that&nbsp; "Not Running - PBS Error: Premature end of message"</font></div><div>&nbsp;</div><div><font face="Arial" size="2">I restarted the server, mom and sched but still i cannot pull it out.</font></div><div><font face="Arial" size="2"></font>&nbsp;</div><div><font face="Arial" size="2">I tried qsig -n SIGNULL jobid , qsig -s SIGKILL jobid, but no success.</font></div><div><font face="Arial" size="2"></font>&nbsp;</div><div><font face="Arial" size="2">I even KILLED the pbs_mom on the defective nodes, started it again and tried the qsig again, but it is still there.</font></div><div><font face="Arial" size="2"></font>&nbsp;</div><div><font face="Arial" size="2">Strangely when i do qdel 23848.bwp4<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span></font><font face="Arial" size="2">the prompt doesnot return, as if waiting for some input ? Has anyone come across this probelm?</font></div><div><font face="Arial" size="2"></font>&nbsp;</div><div><font face="Arial" size="2">This job seems to be stuck there forever.</font><font face="Arial" size="2"></font></div><font face="Arial" size="2"></font><div><font face="Arial" size="2"></font>&nbsp;</div><div><font face="Arial" size="2">----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------</font></div><div><font face="Arial" size="2">Job ID&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Username Queue&nbsp;&nbsp;&nbsp; Jobname&nbsp;&nbsp;&nbsp; SessID NDS TSK Memory Time&nbsp; S Time<br>--------------- -------- -------- ---------- ------ --- --- ------ ----- - -------------------------------------------------<br>23848.bwp4. skhanal&nbsp; parallel&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; my_paralle&nbsp;&nbsp;&nbsp; --&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp; --&nbsp;&nbsp;&nbsp; --&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;02:40 R&nbsp;&nbsp; --<br>&nbsp;</font></div><div><font face="Arial" size="2">&nbsp; node13/0+node12/0+node11/0+node10/0+node09/0<br></font></div><div><font face="Arial" size="2">&nbsp;&nbsp; Not Running - PBS Error: Premature end of message</font></div><div><font face="Arial" size="2">----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------</font></div><div><font face="Arial" size="2"></font>&nbsp;</div><div><font face="Arial" size="2"></font>&nbsp;</div><div><font face="Arial" size="2">Please help, I am stuck.</font></div><div><font face="Arial" size="2"></font>&nbsp;</div><div><font face="Arial" size="2">Samir</font></div><font face="Arial" size="2"><div><br></div></font>_______________________________________________<br>torqueusers mailing list<br><a href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</a><br><a href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</a><br></div></span></blockquote></div><br></div></body></html>