<HTML><BODY style="word-wrap: break-word; -khtml-nbsp-mode: space; -khtml-line-break: after-white-space; ">check and see if there is a lock file in the $PBS_HOME/server_priv directory.<DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV><DIV><BR><DIV><DIV>On Apr 1, 2007, at 10:15 PM, SCIPIONI Roberto wrote:</DIV><BR class="Apple-interchange-newline"><BLOCKQUOTE type="cite"><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Hi there,</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">I installed Torque<SPAN class="Apple-converted-space">  </SPAN>and Maui.</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">I managed to make Torque to read the libraries but<SPAN class="Apple-converted-space">  </SPAN>now when I try to start the server with</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">pbs_server -t create<SPAN class="Apple-converted-space">   </SPAN></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">it says</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">pbs_server -t create</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">PBS_Server: Resource temporarily unavailable (11) in PBS_Server, pbs_server: another server running</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">pbs_server: another server running</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">----------------------------------------------</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">I am confused because there is only one server.</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Probably are the specifications about Headnode and nodes right ?</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Thanks for the help</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Roberto</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV> <FONT face="Nimbus Roman No9 L">Dear All,<BR> <BR> Im having problems in finishing the configuration of the Torque Batch System.<BR> Im using the folowing software packages: <BR> <BR> </FONT> <UL>  <LI><FONT face="Nimbus Roman No9 L">torque-scheduler-2.1.6</FONT></LI>  <LI><FONT face="Nimbus Roman No9 L">torque-client-2.1.6</FONT></LI>  <LI><FONT face="Nimbus Roman No9 L">torque-scheduler-2.1.6</FONT></LI> </UL> <FONT face="Nimbus Roman No9 L"><BR> The queues have been created without any problems and the server can reach by network all the clients. I have checked this last point submiting a simple shell script echo 'date' for 10 times from the server and I can see in the client 10 shell session opened for runing the job.<BR> <BR> Job submission script:<BR> <BR> <FONT color="#ff0000"># queue selected for that job<BR> #PBS -q long<BR> cat $PBS_NODEFILE<BR> #PBS -o /home5/userxxx/pbs.output<BR> #PBS -l nodes=1<BR> #PBS -I<BR> #PBS -r n<BR> #PBS -l walltime=12:00:00<BR> #PBS -M userxxx<BR> #PBS -N teste<BR> #########################################<BR> #       JOB DEFINITION                                       #<BR> #########################################<BR> #!/bin/bash<BR> #!change the working directory (default is home directory)<BR> cd /home5/userxxx/<BR> echo Running on host `hostname` &gt; /home5/userxxx/pbs.output<BR> echo Time is `date` &gt; /home5/userxxx/pbs.output<BR> echo Directory is `pwd` &gt; /home5/userxxx/pbs.output</FONT><BR> <BR> <BR> <BR> The problem is that I cannot see any output writen to any file.<BR> <BR> Here is the relevant line from the server log:<BR> <BR> <BR> <FONT color="#ff0000">03/29/2007 16:27:28;000d;PBS_Server;Job;129.pc061.dq.ua.pt.dq.ua.pt;<B>Post job file processing error</B>; job 129.molecular-modeling.dq.ua.pt on host planck.dq.ua.pt</FONT><BR> <BR> <BR> In our cluster all the home directories are globally shared by NFS to all nodes and I think that scp will no be used in that case but simple cp command.<BR> In my opinion the problems may be file transactions between the submission server and the execution (mom) clients.<BR> <BR> I provide the client configuration file from pbs_mom (config):<BR> <BR> <FONT color="#ff0000"># MOM server configuration file<BR> # if more than one value, separate it by comma.<BR> #<BR> # especifica o servidor de PBS que pode submeter jobs<BR> $pbsserver pc061.dq.ua.pt<BR> # especifica os clientes que o pbs_mom pode contactar atraves de portas privilegiadas<BR> $pbsclient molecular-modeling.dq.ua.pt<BR> $pbsclient planck.dq.ua.pt</FONT><BR> <FONT color="#ff0000">$loglevel 7</FONT><BR> <BR> <BR> I have also checked the undelivered directory in the client (planck.dq.ua.pt) and it is empty.<BR> <BR> Can anyone provide me a clue to suceesfully resolve this problem?<BR> Also if I cannot resolve this issue im planing to migrate the Batch System to Sun Grid Engine. What is your opinion about SGE?<BR> <BR> <BR> Thanks in advance,<BR> <BR> <BR> Best Regard,<BR> <BR> <BR> Nelson Fonseca<BR> </FONT><FONT face="Nimbus Roman No9 L"> Beowulf Cluster </FONT><FONT face="Nimbus Roman No9 L">System Administrator<BR> University of Aveiro<BR> Portugal<BR> <BR> <BR> <BR> <BR> </FONT><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">_______________________________________________</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">torqueusers mailing list</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><A href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</A></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><A href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</A></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">_______________________________________________</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">torqueusers mailing list</DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><A href="mailto:torqueusers@supercluster.org">torqueusers@supercluster.org</A></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><A href="http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers">http://www.supercluster.org/mailman/listinfo/torqueusers</A></DIV> </BLOCKQUOTE></DIV><BR></DIV></BODY></HTML>