<span style="font-family: verdana;">I am such a newbie that I squeek.&nbsp; I hope this is the correct forum in which to ask this question.</span><br style="font-family: verdana;"><br style="font-family: verdana;"><span style="font-family: verdana;">
I want to specify a nodelist other than that which would be $PBS_NODEFILE.&nbsp; I want to specify n10, n11, n12 and n13, each with 4 processors.&nbsp; The node list looks something like this:</span><br style="font-family: verdana;">
<br><span style="font-family: courier new,monospace;">n10:4</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">n11:4</span><br style="font-family: courier new,monospace;">
<span style="font-family: courier new,monospace;">n12:4</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">n13:4</span><br><br><span style="font-family: verdana;">And it is called local_nodelist in the working directory.
</span><br><br>The script sets <span style="font-family: courier new,monospace;">PBS_NODEFILE=`pwd`/local_nodelist</span><br><br><span style="font-family: verdana;">qstat -f while running the script elicits what seems to be an erroneous nodelist 
</span><span style="font-family: courier new,monospace;"><br><br><span style="font-family: courier new,monospace;">Job Id: 76.excalibur<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Job_Name = pbs_mpich.<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Job_Owner = <a href="mailto:joeb@excalibur.example.com">
joeb@excalibur.example.com</a><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; resources_used.cput = 00:00:00<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; resources_used.mem = 4296kb<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; resources_used.vmem = 175988kb<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; resources_used.walltime = 00:00:12<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; job_state = R<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; queue = default
<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; server = </span></span><span style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;"><a href="http://excalibur.example.com">excalibur.example.com</a></span></span><br><span style="font-family: courier new,monospace;">
<span style="font-family: courier new,monospace;">&nbsp;&nbsp;&nbsp; Checkpoint = u<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; ctime = Wed Dec&nbsp; 6 08:54:16 2006<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Error_Path = </span></span><span style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">
<a href="http://excalibur.example.com">excalibur.example.com</a></span></span><span style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">:/home/joeb/pbs_mpich..e76<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<span style="color: rgb(204, 0, 0); font-weight: bold;">
 exec_host = n04/0</span><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Hold_Types = n<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Join_Path = n<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Keep_Files = n<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Mail_Points = a<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; mtime = Wed Dec&nbsp; 6 08:54:17 2006<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Output_Path = </span></span><span style="font-family: courier new,monospace;">
<span style="font-family: courier new,monospace;"><a href="http://excalibur.example.com">excalibur.example.com</a></span></span><span style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">
:/home/joeb/pbs_mpich..o76<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Priority = 0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; qtime = Wed Dec&nbsp; 6 08:54:16 2006<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Rerunable = True<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Resource_List.nodect = 1<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Resource_List.nodes = 1<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; session_id = 31725<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Variable_List = PBS_O_HOME=/home/joeb,PBS_O_LANG=en_US.UTF-8,
<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; PBS_O_LOGNAME=joeb,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; PBS_O_PATH=/opt/torque/bin:/opt/bin:/opt/hdfview/bin:/opt/hdf/bin:/opt<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; /ncarg/bin:/opt/mpich/p4-gnu/bin:/opt/mpiexec//bin:/usr/kerberos/bin:/o<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; pt/java/jdk1.5.0/bin:/usr/lib64/ccache/bin:/usr/local/bin:/bin:/usr/bin
<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; :/usr/X11R6/bin:/opt/java/jdk1.5.0/jre/bin:/opt/visit/bin:/home/joeb/bi<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; n:/opt/mpich/p4-gnu/sbin,PBS_O_MAIL=/var/spool/mail/joeb<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; PBS_O_SHELL=/bin/bash,PBS_O_HOST=</span></span><span style="font-family: courier new,monospace;">
<span style="font-family: courier new,monospace;"><a href="http://excalibur.example.com">excalibur.example.com</a></span></span><span style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">
,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; PBS_O_WORKDIR=/home/joeb,PBS_O_QUEUE=default<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; comment = Job started on Wed Dec 06 at 08:54<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; etime = Wed Dec&nbsp; 6 08:54:16 2006<br></span>---------------------------------------------------------------------------------
<br><br><span style="font-family: verdana;">However, the script output looks like this:<br><br><span style="font-family: courier new,monospace;">Job ID: <a href="http://76.excalibur.example.com">76.excalibur.example.com</a>
<br>Working directory is /home/joeb<br>Running on host <a href="http://n04.example.com">n04.example.com</a><br>Time is Wed Dec 6 08:54:17 PST 2006<br>Directory is /home/joeb<br>The node file is /net/fs/home/joeb/local_nodefile
<br><span style="font-weight: bold; color: rgb(204, 0, 0);">This job runs on the following processors:</span><br style="font-weight: bold; color: rgb(204, 0, 0);"><span style="font-weight: bold; color: rgb(204, 0, 0);"><a href="http://n09.example.com:4">
n09.example.com:4</a> <a href="http://n10.example.com:4">n10.example.com:4</a> <a href="http://n11.example.com:4">n11.example.com:4</a> <a href="http://n12.example.com:4">n12.example.com:4</a></span><br style="font-weight: bold; color: rgb(204, 0, 0);">
<span style="font-weight: bold; color: rgb(204, 0, 0);">This job has allocated 4 nodes/processors.</span><br><br>/usr/local/bin/mpich/x86_64/p4/gnu/bin/mpirun -nolocal -np 4 -machinefile /net/fs/home/joeb/local_nodefile /usr/local/bin/mpich/p
<br>4-gnu/examples/cpi<br><br>pi is approximately 3.1416009869231249, Error is 0.0000083333333318<br>wall clock time = 0.003906<br></span></span></span><span style="font-family: courier new,monospace;">---------------------------------------------------------------------------------
</span><br><span style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: verdana;"><span style="font-family: courier new,monospace;"><br><span style="font-family: verdana;">Can anyone explain why the output of qstat -f and the script echo statements differ, and how can I determine which is correct?&nbsp; (Short of sleeping for a while while I look for all the processes?)
<br><br>Thanks,<br>dave<br></span><br></span></span></span>