<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD><TITLE>RE: [Mauiusers] completed jobs still shown in queue</TITLE>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii">
<META content="MSHTML 6.00.2900.2802" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV dir=ltr align=left><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=632212321-01032006>Neither, it was just a short shell script. I posed it 
earlier. Here it is again, in case you missed it. </SPAN></FONT></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=632212321-01032006></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT size=2><SPAN 
class=632212321-01032006>#!/bin/bash<BR>echo "Hello from $(uname -n)"<BR>sleep 
20<BR>printenv | egrep "PBS_NODENUM|PBS_VNODENUM|PBS_TASKNUM|PBS_O_HOST" | 
sort<BR>echo " "<BR>exit 0</SPAN></FONT></DIV>
<P><FONT face=Arial size=2>Prentice </FONT></P><BR>
<DIV class=OutlookMessageHeader lang=en-us dir=ltr align=left>
<HR tabIndex=-1>
<FONT face=Tahoma size=2><B>From:</B> Stewart.Samuels@sanofi-aventis.com 
[mailto:Stewart.Samuels@sanofi-aventis.com] <BR><B>Sent:</B> Wednesday, March 
01, 2006 2:57 PM<BR><B>To:</B> Bisbal, Prentice; 
mauiusers@supercluster.org<BR><B>Subject:</B> RE: [Mauiusers] completed jobs 
still shown in queue<BR></FONT><BR></DIV>
<DIV></DIV>
<DIV><SPAN class=904285619-01032006><FONT face=Verdana color=#0000ff size=2>Just 
curious, are you using pvm or mpi with these jobs?</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=904285619-01032006><FONT face=Verdana color=#0000ff 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN 
class=904285619-01032006>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<FONT face=Verdana color=#0000ff size=2>Stewart</FONT></SPAN></DIV>
<BLOCKQUOTE dir=ltr style="MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV class=OutlookMessageHeader dir=ltr align=left><FONT face=Tahoma 
  size=2>-----Original Message-----<BR><B>From:</B> Bisbal, Prentice 
  [mailto:PBisbal@LexPharma.com]<BR><B>Sent:</B> Wednesday, March 01, 2006 1:30 
  PM<BR><B>To:</B> Samuels, Stewart PH/US; 
  mauiusers@supercluster.org<BR><B>Subject:</B> RE: [Mauiusers] completed jobs 
  still shown in queue<BR><BR></FONT></DIV><!-- Converted from text/plain format -->
  <P><FONT size=2>qdel didn't work for me - something about the job being in an 
  invalid state for that operation.<BR><BR>All the jobs involved were on a 
  system that was very loaded (8 cpus, all at 99% usage). I suspect the heavy 
  loading of the system caused delays in communication which in turn caused some 
  sort fo message time out.<BR><BR>Prentice<BR><BR><BR><BR>-----Original 
  Message-----<BR>From: Stewart.Samuels@sanofi-aventis.com [<A 
  href="mailto:Stewart.Samuels@sanofi-aventis.com">mailto:Stewart.Samuels@sanofi-aventis.com</A>]<BR>Sent: 
  Wed 3/1/2006 12:45 PM<BR>To: Bisbal, Prentice; 
  mauiusers@supercluster.org<BR>Subject: RE: [Mauiusers] completed jobs still 
  shown in queue<BR><BR>We se the same behavior periodically.&nbsp; We are 
  running torque-1.2.0p1 and maui-3.2.6p11.&nbsp; Not only is this an anoyance, 
  but it also prevents maui from scheduling jobs on those nodes.&nbsp; Most of 
  the time you can qdel 
  them.<BR><BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  Stewart<BR><BR>-----Original Message-----<BR>From: 
  mauiusers-bounces@supercluster.org [<A 
  href="mailto:mauiusers-bounces@supercluster.org">mailto:mauiusers-bounces@supercluster.org</A>]On 
  Behalf Of Bisbal, Prentice<BR>Sent: Wednesday, March 01, 2006 10:03 AM<BR>To: 
  mauiusers@supercluster.org<BR>Subject: [Mauiusers] completed jobs still shown 
  in queue<BR><BR><BR><BR>I have 4 simple jobs stuck in my queue. The jobs ran 
  to completion, but they are still shown as being in the queue:<BR><BR><BR>$ 
  showq<BR>ACTIVE 
  JOBS--------------------<BR>JOBNAME&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  USERNAME&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; STATE&nbsp; PROC&nbsp;&nbsp; 
  REMAINING&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  STARTTIME<BR><BR>3183&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  pxxxxxx&nbsp;&nbsp;&nbsp; Running&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  00:46:01&nbsp; Wed Mar&nbsp; 1 
  09:44:58<BR>3184&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  pxxxxxx&nbsp;&nbsp;&nbsp; Running&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  00:46:04&nbsp; Wed Mar&nbsp; 1 
  09:45:01<BR>3185&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  pxxxxxx&nbsp;&nbsp;&nbsp; Running&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  00:46:04&nbsp; Wed Mar&nbsp; 1 
  09:45:01<BR>3186&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  pxxxxxx&nbsp;&nbsp;&nbsp; Running&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  00:46:04&nbsp; Wed Mar&nbsp; 1 09:45:01<BR><BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4 
  Active Jobs&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4 of&nbsp;&nbsp; 22 Processors 
  Active 
  (18.18%)<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  1 of&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7 Nodes Active&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  (14.29%)<BR><BR>A tracejob shows that these jobs completed and exited w/o any 
  errors:<BR><BR>$&nbsp; tracejob 3186<BR><BR>Job: 
  3186.hw-emperor.lexpharma.com<BR><BR>03/01/2006 09:43:38&nbsp; 
  S&nbsp;&nbsp;&nbsp; enqueuing into batch, state 1 hop 1<BR>03/01/2006 
  09:43:38&nbsp; S&nbsp;&nbsp;&nbsp; Job Queued at request 
  of<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  pxxxxxx@hw-underdog.xxxxxxxxx.com owner 
  =<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  pxxxxxx@hw-underdog.xxxxxxxxx.com, job name 
  =<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  PBS_TEST.87, queue = batch<BR>03/01/2006 09:45:02&nbsp; S&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  Job Modified at request 
  of<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  maui@hw-emperor.lexpharma.com<BR>03/01/2006 09:45:02&nbsp; S&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  Job Run at request of maui@hw-emperor.xxxxxxxxxx.com<BR>03/01/2006 
  09:45:33&nbsp; S&nbsp;&nbsp;&nbsp; Exit_status=0 
  resources_used.cpupercent=0<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  resources_used.cput=00:00:00 
  resources_used.mem=5408kb<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  resources_used.vmem=9280kb<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  resources_used.walltime=00:00:30<BR><BR>Any idea why these jobs are still 
  shown in the queue? What is the best way to get rid of 
  them?<BR><BR>Prentice<BR><BR><BR><BR></FONT></P></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>